CAS No: | / |
---|---|
Formül: | / |
EINECS: | / |
Sınıflandırma: | Biyokimyasal reaktifler |
Derece: | Reagent Grade |
Özel Kullanım: | Biyolojik amaçlı, Mikrobiyolojik, Mikroskopik Amaç için, PCR, Southern Blot and Enzyme Digestion |
Doğrulanmış işletme lisanslarına sahip tedarikçiler
HiPure toprak DNA Kiti
CAT NO | ÜRÜN ADI | BOYUT | FIYAT |
D314202 | HiPure toprak DNA Kiti | 50 hazırlık | 249.00 ABD Doları |
D314203 | HiPure toprak DNA Kiti | 250 hazırlık | 1,144.00 ABD Doları |
Giriş
Toprak örnekleri, çoğu üretim ve araştırma için doğrudan eklenemeyen çok sayıda mikroorganizma içerir. Toprak örneklerinden DNA çıkarmak, toprak mikroorganizmaları inceleyen en etkili yöntemdir. Şu anda, mikrobiyal DNA'yı toprak numunelerinden çıkarmak için temel olarak doğrudan ve dolaylı yöntemler vardır.
Doğrudan yöntem, liz çözeltisine toprak örnekleri yerleştirme ve tüm mikrobiyal DNA'yı liz çözeltisine serbest bırakmak için etkili duvar kırma yöntemleri kullanma, ardından Zhou yöntemi gibi ayırma ve çıkarma anlamına gelir. Dolaylı yöntem, mikroorganizmaları topraktan ayırmak ve ardından DNA çıkarmak için tampon PBS gibi bir tampona toprak yerleştirmeyi ifade eder.
Dolaylı yöntem, toprakta DNA çıkarma üzerindeki nemli asitlerin ve ağır metal tuzların etkisini büyük ölçüde azaltabilir, ancak bu yöntem birçok mikroorganizmayı kaybedecek ve ortaya çıkan DNA toprak numunesinin tüm genom (metagenom) olmayıp ortaya çıkacak. Şu anda bu yöntemi birkaç araştırmacı benimsemiştir. DNA'yı doğrudan toprak numunelerinden çıkarmak, genomun tamamını alma olasılığını en üst düzeye çıkarabilir ancak bu yöntem aşağıdaki sorunlarla karşı karşıya:
1.Nem asidi kirliliği.
Özellikle ormanlarda ve çayırlarda, toprak, nemli asitlerle zengindir. Humic Asit, bazıları nükleik asit moleküllerine çok benzeyen ve arıtma sırasında çıkarması zor olan bir dizi organik moleküldür. İzlem miktarlarındaki nemli asit kirliliği PCR ve enzim sindirim arızası gibi aşağı akış uygulamalarına yol açabilir.
2.Likis yöntemi.
Toprak örnekleri bakteri ve mantarlar gibi çeşitli mikroorganizmalar içerir. Gram pozitif bakteriler ve mantarların her ikisi de çok kalın bakteriyel duvarlar içerir ve bu mikroorganizmaların hücre duvarlarını etkili bir şekilde parçamak, yüksek verimli metajenomik DNA'nın çıkarılması için çok önemlidir. Toprak numunelerinin karmaşıklığı nedeniyle enzimatik yöntemler (lisozyme, duvar kırma enzimi, salyangoz enzimi gibi) veya sıvı nitrojen taşlama kullanmak mümkün değildir; çünkü toprakta sindirim enzimlerini inaktif eden çeşitli metalionlar veya inhibitör faktörler bulunur, ya da toprakta kum parçacıkları bulunması, sıvı nitrojen taşlama işlemi zorlaştırır.
3.DNA'nın verimini kontrol etmek zor.
Toprak numunelerinin doğurganlık, kıdem, yüksek nem içeriği, kuruluk veya numune alma derinliği nedeniyle mikroorganizma sayısı ve çeşidi önemli ölçüde değişeceklerdir. Küçük bir toprak örneği yelpazesinde DNA içeriği genellikle binlerce kez değişir. Ayrıca, topraktaki ağır metal tuzlar ve kil maddeler gibi bazı kimyasal bileşenler DNA veriminde düşüşe neden olabilir.
Magen'in HiPure toprak DNA Kitleri, toprak DNA'sı çıkarma için en iyi hale getirilmiş kit olarak yer alıyorlar. Kit, özel damla taşlama aleti olmadan nokta vorteks cihazında gerçekleştirilebilen ve çok çeşitli laboratuvarlar için uygun olan cam boncuk taşlama yöntemini ve termal şok kimyasal duvar kırma yöntemini kullanır. Reaktif kitindeki Ambursör Çözeltisi, özellikle Magen Company tarafından geliştirilen ve çeşitli nemli asit kirleticilerini etkili bir şekilde temizleyen bir nemli asit soğurucu biçimidir. Ayrıca, çeşitli çözünebilir metal tuzları ve diğer çözünebilir engelleyici faktörleri toprağdan etkili bir şekilde temizlemek için alkolsüz silika jel kolonu temizleme yöntemi de kullanılır. Kit aşağıdaki topraktan başarıyla çıkarıldı (kısmen müşteri geri bildirimlerine dayanarak): Doğal yedeklerdeki ormanlardan toprak (30 cm'lik desikuşe tabakası olan 30 ila 40 yıllık eski orman toprağı), mangrov toprağı, çayırlar, tarım arazileri, deniz çamuru, çamur, mineral alan toprağı, organik madde kirli toprak, süs havuzu çamuru, çöp çamuru, klima boru hattı tortuları vb.
Bu ürün, çeşitli toprak örneklerinden yüksek kaliteli genomik DNA'nın hızlı ve güvenilir bir şekilde izole edilmesini sağlar. 60 dakikada 500 mg'a kadar toprak numuneleri işlenebilir. Sistem, toprağın numunelerinden gelen humik asit gibi PCR inhibiting bileşiklerini ortadan kaldırmak için HiPure matrisinin ters çevrilebilir nükleik asit bağlama özelliklerini spin kolonu teknolojisinin hızı ve çok yönlülük özellikleriyle birleştirir. Saflaştırılmış DNA PCR, kısıtlama sindirimi ve yeni nesil sıralama için uygundur. Bu nedenle, birden fazla numunenin paralel olarak işlenmesine olanak tanımak için plastik atığı ve uygulamalı zamanı azaltan organik ekstraksiyonlar yoktur.
Detaylar
Özellikler | Teknik Özellikler |
Ana fonksiyonlar | 200 mg toprak örneğinden yalıtım DNA'sı |
Uygulamalar | PCR, güney blot ve enzim sindirimi, vs |
Arıtma yöntemi | Mini döner sütun |
Arıtma teknolojisi | Silika teknolojisi |
İşlem yöntemi | Manuel (santrifüj veya vakum) |
Numune türü | Toprak |
Örnek miktarı | 200 mg |
Elma hacmi | ≥ 30 μl |
Koşu BAŞINA süre | ≤ 60 dakika |
Sütun başına sıvı taşıma hacmi | 800 μl |
Sütunun ciltleme verimi | 100 μg |
Prensip
Toprak numunesi homojen hale getirilip liz bakterileri, maya ve mantar numunelerine deterjan içeren özel formüle edilmiş bir tamponla işlenir. Nemli asit, proteinler, polisakkaritler ve diğer kirleticiler, tescilli Emici çözümümüz kullanılarak çıkarılır. Daha sonra ciltleme koşulları ayarlanır ve numune DNA Mini sütununa uygulanır. İki hızlı yıkama adımı, iz kirleticileri ortadan kaldırır ve saf DNA düşük iyonik güçlü tamponla elenir. Saflaştırılmış DNA, daha fazla arıtma ihtiyacı olmadan doğrudan aşağı akış uygulamalarında kullanılabilir.
Avantajlar
Kit İçeriği
İçindekiler | D314202 | D314203 |
Arıtma süreleri | 50 Hazırlık | 250 Hazırlık |
Hipure DNA Mini Sütunlar II | 50 | 250 |
2 ml Numune Alma tüpleri | 50 | 250 |
2 ml Bead Tüpler | 50 | 250 |
Tampon sol | 60 ml | 250 ml |
Tampon SDS | 5 ml | 20 ml |
Tampon PS | 10 ml | 50 ml |
Emici Çözümü | 10 ml | 50 ml |
Tampon GWP | 40 ml | 220 ml |
Tampon DW1 | 30 ml | 150 ml |
Tampon GW2 * | 20 ml | 2 x 50 ml |
Tampon AE | 15 ml | 30 ml |
On Depolama ve Destek
Emici Çözeltisi, varışta 2-8°C'de saklanmalıdır. Ancak, oda sıcaklığında (15-25°C) kısa süreli depolama (24 haftaya kadar) performanslarını etkilemez. Kalan kit bileşenleri oda sıcaklığında (15-25°C) kuru olarak saklanabilir ve bu koşullarda en az 18 ay stabildir.
Doğrulanmış işletme lisanslarına sahip tedarikçiler